2020年3月，國家藥監局開展第二批重點實驗室申報工作。2021年1月，第二批重點實驗室名單開始公示。2021年2月，國家藥監局認定體外診斷試劑質量研究與評價等第二批72個重點實驗室并公布。

突如其來的新冠肺炎疫情為提升應對突發公共衛生事件能力敲響警鐘。在這次評選中，提升藥品監管部門應對重大突發公共衛生事件藥械審評保障能力成為綜合評審的重要考量。以中國食品藥品檢定研究院為依托單位的體外診斷試劑質量研究與評價重點實驗室、以河南省醫療器械檢驗所、首都醫科大學附屬北京天壇醫院為依托單位的體外診斷試劑質量控制重點實驗室、以北京市醫療器械檢驗所為依托單位的體外診斷試劑質量評價重點實驗室、以中國檢驗檢疫科學研究院為依托單位的體外快速診斷試劑技術轉化與控制重點實驗室等被納入綜合審評并獲得認定。這些重點實驗室將為藥品監管部門加強疫情防控用藥械檢驗技術研究提供有力支撐。

2019年7月，國家藥監局公布首批45家重點實驗室。加上本次新獲批的72家重點實驗室，國家藥監局重點實驗室已達到117家。